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FileMaker Go for iPadとFileMaker Go for iPhoneは、次の製品で作成されたFileMakerデータベースを開くことができます。

・FileMaker Pro（バージョン11、10、9、8.5、8、7）
・FileMaker Pro Advanced（バージョン11、10、9、8.5、8）
・FileMaker Developer（バージョン7）

バージョン6以前とバージョン7以降のファイルフォーマットは異なるため、ファイルメーカーPro 6で作成されたデータベースファイルをFileMaker Goでそのまま開くことはできません。

なお、FileMaker Goは、FileMaker ProおよびFileMaker Pro Advanced、FileMaker Server、FileMaker Server Advancedのバージョン11とバージョン10でホストされたデータベースに接続できます。これ以前のバージョンでホストされたデータベースを開けるかどうかについては特にテストされていないとのことです。